Les développeurs de Facebook, Google et Amazon Web Services rejoindront universitaires ce week-end pour un hackathon qui verra les données génétiques fournies par Cancer Research UK, transformé en un citoyen science smartphone jeu app.
Le jeu, provisoirement nommé GeneRun, permettra au public de chercher des changements courants dans les gènes--causés par un gain ou une perte des chromosomes--qui forment des tumeurs cancéreuses du sein pour aider à expliquer que mutations conduire le cancer. L'idée est de crowdsource enquête scientifique qui prendre autrement ans travailleurs lab chaluter par, et accélérer ciblées invention de drogue significativement.
« Futurs cancéreux bénéficieront d'un traitement ciblé à l'empreinte génétique de leur tumeur et nous souhaitons que ce projet passionnant avec impatience le jour où que cela devienne une réalité », a déclaré Carlos Caldas, chef de groupe senior au Cancer Research UK Cambridge Institute, Université de Cambridge. « Nous faisons de grands progrès dans la compréhension que des raisons génétiques de cancer se développe. Mais les indices à pourquoi certains médicaments ne fonctionnera pas et certains ne sont tenues dans les données qui doivent être analysés par le œil humain--et cela pourrait prendre des années. En exploitant la puissance collective des chercheurs bénévoles nous allons accélérer la découverte de nouvelles façons de diagnostiquer et de traiter le cancer beaucoup plus précisément. »
Le jeu--le produit final d'un hack de trois jours 40 participants au Campus de Google dans l'est londonien--sera hébergé sur une plate-forme fournie par Amazon Web Services, et des universitaires invités vers le bas par Facebook à prendre part (dont certains de la City University London) aura l'avantage de leurs conseils et leurs ressources. Le dernier match sera élaboré par un organisme, avec un lancement prévu depuis un certain temps de cet été. L'ensemble du projet est exécuté en collaboration avec Citizen Science Alliance, le corps derrière les chasseurs de la planète.
"Nous croyons que le meilleur pour résoudre un problème consiste à amener des gens intelligents pour « pirater » une solution," a déclaré Philip Su, directeur de l'ingénierie site de Londres de Facebook,. « Cette approche est tout aussi valable dans le domaine des sciences de la vie comme elle est dans le génie logiciel. Que nous soyons impliqués dans quelque chose aussi importantes que la recherche de traitements pour le cancer est un immense honneur et nous espérons aider à bâtir sur le travail incroyable accompli par Cancer Research UK. »
Le projet arrive plusieurs mois après le succès de CellSlider, qui a vu le public a accès à une plateforme web pour identifier les cellules irrégulières d'échantillons de tissus définis par un excès de la protéine réceptrice de le œstrogène, un signe de cancer du sein. Cette fois-ci, les données collectées à partir des puces à ADN, qui mesurent l'expression des gènes. Stark, changements dans le nombre de gènes peuvent être relativement simple pour un algorithme informatique à repérer, et c'est ce qui se passe maintenant dans les laboratoires. Toutefois, déterminer exactement quand ces changements démarrer et arrêter des exigences un oeil plus subtil, humain et permet de retracer exactement quels gènes est impliqués dans l'évolution du cancer. La seule façon que nous trouverons des motifs est si nous passons par ce même processus pour les échantillons de beaucoup, beaucoup, beaucoup, beaucoup de patients--quelque chose qui prend des années à faire (même si les puces à fournissent un raccourci par analyse des milliers d'échantillons simultanément). Découvrir la génétique mise à la terre et la voie des cancers est le chemin d'accès à un traitement ciblé et en temps opportun et remèdes éventuels.
« En exploitant la force collective du public, cellule Slider a déjà montré comment nous pouvons réduire considérablement le temps d'analyse pour certains de nos données d'essais cliniques depuis dix-huit ans à trois mois, » a souligné Harpal Kumar, chef de la direction de Cancer Research UK.
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